Сегодня посмотрел на достаточно универсальный видео конвертер под простым названием SUPER (спасибо Avangebit за ссылочку). Программа умеет конвертировать практически из всего во все. Очень подойдет опытным пользователям для работы, потому что в ней можно задавать достаточно тонко настройки конвертации.